MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB6

Total Repeats: 2523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009931	TCA	2	6	34174	34179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341288
502	NC_009931	TC	3	6	34186	34191	0 %	50 %	0 %	50 %	158341288
503	NC_009931	CCA	2	6	34195	34200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158341288
504	NC_009931	GTG	2	6	34207	34212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158341288
505	NC_009931	AG	3	6	34242	34247	50 %	0 %	50 %	0 %	158341288
506	NC_009931	AAT	2	6	34302	34307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158341288
507	NC_009931	CGG	2	6	34340	34345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158341288
508	NC_009931	GAG	2	6	34389	34394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158341288
509	NC_009931	GTT	2	6	34416	34421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158341288
510	NC_009931	GA	3	6	34444	34449	50 %	0 %	50 %	0 %	158341288
511	NC_009931	CGA	2	6	34463	34468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341288
512	NC_009931	TCA	2	6	34513	34518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341288
513	NC_009931	TGC	2	6	34529	34534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341288
514	NC_009931	TGT	2	6	34545	34550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158341288
515	NC_009931	C	6	6	34553	34558	0 %	0 %	0 %	100 %	158341288
516	NC_009931	AAG	2	6	34664	34669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158341288
517	NC_009931	GCC	2	6	34671	34676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158341288
518	NC_009931	TGTC	2	8	34712	34719	0 %	50 %	25 %	25 %	158341288
519	NC_009931	GCAG	2	8	34760	34767	25 %	0 %	50 %	25 %	158341288
520	NC_009931	CGG	2	6	34826	34831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158341288
521	NC_009931	CTT	2	6	34839	34844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158341288
522	NC_009931	AGC	2	6	34879	34884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341288
523	NC_009931	T	6	6	34927	34932	0 %	100 %	0 %	0 %	158341288
524	NC_009931	TAT	2	6	35029	35034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158341287
525	NC_009931	T	8	8	35043	35050	0 %	100 %	0 %	0 %	158341287
526	NC_009931	TTG	2	6	35063	35068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158341287
527	NC_009931	TGGCA	2	10	35074	35083	20 %	20 %	40 %	20 %	158341287
528	NC_009931	ATG	2	6	35084	35089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341287
529	NC_009931	TGA	2	6	35104	35109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341287
530	NC_009931	TTA	2	6	35120	35125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158341287
531	NC_009931	AAT	2	6	35133	35138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158341287
532	NC_009931	ATC	2	6	35191	35196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341287
533	NC_009931	CCG	3	9	35225	35233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158341286
534	NC_009931	TTG	2	6	35359	35364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158341286
535	NC_009931	CA	3	6	35398	35403	50 %	0 %	0 %	50 %	158341286
536	NC_009931	GAA	2	6	35404	35409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158341286
537	NC_009931	GTG	2	6	35429	35434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158341286
538	NC_009931	CGG	2	6	35559	35564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158341286
539	NC_009931	CTG	2	6	35596	35601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341286
540	NC_009931	GAA	2	6	35622	35627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158341286
541	NC_009931	TGG	2	6	35669	35674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158341286
542	NC_009931	G	6	6	35696	35701	0 %	0 %	100 %	0 %	158341286
543	NC_009931	GAA	2	6	35731	35736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158341286
544	NC_009931	GGC	2	6	35816	35821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158341286
545	NC_009931	AAT	2	6	35844	35849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158341286
546	NC_009931	GTG	2	6	35873	35878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158341286
547	NC_009931	TGC	2	6	35880	35885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341286
548	NC_009931	TGGT	2	8	35896	35903	0 %	50 %	50 %	0 %	158341286
549	NC_009931	AGA	2	6	35904	35909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158341286
550	NC_009931	TGCA	2	8	35930	35937	25 %	25 %	25 %	25 %	158341286
551	NC_009931	CGTC	2	8	35982	35989	0 %	25 %	25 %	50 %	158341286
552	NC_009931	TTAG	2	8	36525	36532	25 %	50 %	25 %	0 %	158341284
553	NC_009931	CTG	2	6	36583	36588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341284
554	NC_009931	TGGT	2	8	36597	36604	0 %	50 %	50 %	0 %	158341284
555	NC_009931	C	6	6	36720	36725	0 %	0 %	0 %	100 %	158341284
556	NC_009931	GTC	2	6	36730	36735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341284
557	NC_009931	TGG	2	6	36741	36746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158341284
558	NC_009931	TTG	2	6	36774	36779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158341284
559	NC_009931	GCT	2	6	36809	36814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341284
560	NC_009931	TCAA	2	8	36817	36824	50 %	25 %	0 %	25 %	158341284
561	NC_009931	TTGA	2	8	36976	36983	25 %	50 %	25 %	0 %	158341285
562	NC_009931	TGA	2	6	37014	37019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341285
563	NC_009931	CA	3	6	37048	37053	50 %	0 %	0 %	50 %	158341285
564	NC_009931	AGA	2	6	37155	37160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158341285
565	NC_009931	CCT	2	6	37333	37338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158341283
566	NC_009931	GGGT	2	8	37344	37351	0 %	25 %	75 %	0 %	158341283
567	NC_009931	CGC	2	6	37387	37392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158341283
568	NC_009931	GTT	2	6	37402	37407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158341283
569	NC_009931	TGG	2	6	37502	37507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158341283
570	NC_009931	ACC	2	6	37516	37521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158341283
571	NC_009931	TGT	2	6	37524	37529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158341283
572	NC_009931	GGC	2	6	37558	37563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158341283
573	NC_009931	ATG	2	6	37625	37630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341283
574	NC_009931	TCGC	2	8	37631	37638	0 %	25 %	25 %	50 %	158341283
575	NC_009931	GATG	2	8	37716	37723	25 %	25 %	50 %	0 %	158341283
576	NC_009931	TGA	2	6	37821	37826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341283
577	NC_009931	GGT	2	6	37857	37862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158341283
578	NC_009931	GGC	2	6	37887	37892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158341283
579	NC_009931	CTT	2	6	37942	37947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158341283
580	NC_009931	AGG	2	6	37964	37969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158341283
581	NC_009931	ACT	2	6	38058	38063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341283
582	NC_009931	GCTC	2	8	38073	38080	0 %	25 %	25 %	50 %	158341283
583	NC_009931	AGA	2	6	38184	38189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158341283
584	NC_009931	T	6	6	38215	38220	0 %	100 %	0 %	0 %	158341283
585	NC_009931	ATCG	2	8	38254	38261	25 %	25 %	25 %	25 %	158341283
586	NC_009931	GAA	2	6	38263	38268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158341283
587	NC_009931	TCT	2	6	38362	38367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158341283
588	NC_009931	GAC	2	6	38376	38381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341283
589	NC_009931	GCT	2	6	38430	38435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341283
590	NC_009931	G	6	6	38449	38454	0 %	0 %	100 %	0 %	158341283
591	NC_009931	GTA	2	6	38527	38532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341283
592	NC_009931	AGG	2	6	38577	38582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158341283
593	NC_009931	AAAG	2	8	38585	38592	75 %	0 %	25 %	0 %	158341283
594	NC_009931	CGC	3	9	38674	38682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158341283
595	NC_009931	AGC	2	6	38834	38839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341283
596	NC_009931	CAG	2	6	38974	38979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341283
597	NC_009931	AATGAA	2	12	39034	39045	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	158341283
598	NC_009931	TGG	2	6	39089	39094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158341283
599	NC_009931	CAAGC	2	10	39121	39130	40 %	0 %	20 %	40 %	158341283
600	NC_009931	AC	3	6	39135	39140	50 %	0 %	0 %	50 %	158341283
601	NC_009931	ACT	2	6	39185	39190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341283
602	NC_009931	CTA	2	6	39342	39347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341283
603	NC_009931	CGGT	2	8	39384	39391	0 %	25 %	50 %	25 %	158341283
604	NC_009931	AAG	2	6	39458	39463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158341283
605	NC_009931	TCT	2	6	39493	39498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158341283
606	NC_009931	CTG	2	6	39514	39519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341283
607	NC_009931	CAT	2	6	39594	39599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341283
608	NC_009931	TCAAA	2	10	39644	39653	60 %	20 %	0 %	20 %	158341283
609	NC_009931	CGT	2	6	39672	39677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341283
610	NC_009931	ATCG	2	8	39772	39779	25 %	25 %	25 %	25 %	158341283
611	NC_009931	GATC	2	8	39870	39877	25 %	25 %	25 %	25 %	158341283
612	NC_009931	ACC	2	6	39967	39972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158341283
613	NC_009931	CCAG	2	8	40021	40028	25 %	0 %	25 %	50 %	158341283
614	NC_009931	GCA	3	9	40055	40063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341283
615	NC_009931	TGA	2	6	40146	40151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341283
616	NC_009931	ATG	2	6	40212	40217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158341282
617	NC_009931	GAA	2	6	40227	40232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158341282
618	NC_009931	GAC	2	6	40235	40240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158341282
619	NC_009931	AAG	2	6	40300	40305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158341282
620	NC_009931	AAT	2	6	40319	40324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158341282
621	NC_009931	TCG	2	6	40349	40354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158341282
622	NC_009931	CAT	2	6	40376	40381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341282
623	NC_009931	T	6	6	40569	40574	0 %	100 %	0 %	0 %	158341282
624	NC_009931	GCC	2	6	40645	40650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158341282
625	NC_009931	TAC	2	6	40657	40662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158341282
626	NC_009931	GAA	2	6	40674	40679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158341282
627	NC_009931	CCAT	2	8	40681	40688	25 %	25 %	0 %	50 %	158341282
628	NC_009931	AT	3	6	40703	40708	50 %	50 %	0 %	0 %	158341282
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